NesenĶīnas CDC iknedēļas izdevums2025. gada oktobrī publicēja svarīgu pētniecības rakstu, kurā aprakstīta epidemioloģiskā un etioloģiska izmeklēšana par akūtu gastroenterīta uzliesmojumu, ko izraisīja C grupas rotavīruss (RVC) Ludžou, Sičuaņas provinces, pamatskolā. Jāatzīmē, ka izšķiroša nozīme izmeklēšanā bija Macro & Micro-Test augstas caurlaidības mērķtiecīgas patogēnu uztveršanas komplektam (zondes uztveršanai) un pilna genoma bagātināšanas sekvencēšanas tehnoloģijai. Nodrošinot precīzu patogēnu identifikāciju un visaptverošu genoma raksturojumu, tehnoloģija sniedza kritiski svarīgus zinātniskus pierādījumus ātrai uzliesmojuma apstiprināšanai, precīzai avota izsekošanai un efektīvai uzliesmojuma kontrolei.
Pēkšņs uzliesmojums: pirmais ziņotais RVC uzliesmojums Ķīnas dienvidrietumos
2025. gada 15. oktobrī Ludžou pamatskolā notika akūta gastroenterīta uzliesmojums. Skolā kopumā mācījās 1943 skolēni un darbinieki, un ziņots par 32 saslimšanas gadījumiem, tostarp 6 laboratoriski apstiprinātiem un 26 klīniski diagnosticētiem gadījumiem, kā rezultātā kopējais saslimstības līmenis bija 1,65%. Uzliesmojums sasniedza maksimumu laikā no 15. līdz 16. oktobrim, un visaugstākais saslimstības līmenis bija 7. klases 5. klasē (23,08%). Lielākā daļa pacientu bija skolas vecuma bērni (vidējais vecums: 10 gadi), kuriem galvenokārt bija vemšana (65,62%), caureja (46,87%) un sāpes vēderā (37,50%). Simptomi parasti ilga 1–3 dienas, un visi pacienti atveseļojās bez smagām komplikācijām.
Epidemioloģiskajā izmeklēšanā par galveno saslimušo tika identificēts 11 gadus vecs zēns 7. klases 5. klasē. Viņa jaunākajai māsai pirms viņa bija attīstījušies līdzīgi simptomi, kas liecina par vīrusa pārnešanu mājsaimniecībā kā sākotnējo avotu. Nepietiekama vemšanas apkarošana skolas teritorijā, tostarp tieša slaucīšana un utilizācija bez savlaicīgas dezinfekcijas vai zonas izolācijas, apvienojumā ar sliktu roku higiēnu skolēnu vidū, iespējams, veicināja tālāku vīrusa pārnešanu. Lielākā daļa skarto klašu atradās starp otro un piekto stāvu un koplietoja blakus esošās vīriešu tualetes, kas norāda, ka gan aerosolu, gan kontakta pārnešana varēja veicināt vīrusa izplatību.
Izmeklēšana kļuva īpaši sarežģīta, jo regulāra patogēnu skrīnings, tostarp norovīrusa un A grupas rotavīrusa testi, deva negatīvus rezultātus, kas norāda, ka atbildīgs ir reti sastopams patogēns.
Etioloģiskā diagnoze: Makro un mikrotesta pilna genoma sekvencēšana identificē vainīgo
Sākotnējie norovīrusa testi bija negatīvi. Pēc tam Ludžou CDC izmantoja daudzkārtēju kuņģa-zarnu trakta patogēnu reāllaika PCR testu, kas spēj vienlaikus noteikt 28 patogēnus, tostarp 8 vīrusus, 17 baktērijas un 3 parazītus, lai pārbaudītu astoņus klīniskos paraugus. 17. oktobrī sešiem paraugiem tika konstatēta C grupas rotavīrusa klātbūtne, veiksmīgi identificējot izraisītāju.
Lai vēl precīzāk izsekotu uzliesmojuma avotu, pētnieki veica gan nanoporu metagenomisko sekvencēšanu, gan Macro & Micro-Test zondes uztveršanas pilna genoma bagātināšanas sekvencēšanu pieciem pozitīviem paraugiem. Šī pieeja veiksmīgi ģenerēja piecas pilnīgas RVC genoma sekvences (SC01–SC05). Integrētā ātrās multipleksās PCR skrīninga stratēģija, kam sekoja augstas izšķirtspējas pilna genoma sekvencēšana, nodrošināja stabilu tehnisko atbalstu precīzai molekulārajai epidemioloģijai un avota izsekošanai.
Zinātniskas atziņas: M2 genotipa pirmā identifikācija Ķīnas dienvidrietumos
Pamatojoties uz augstas kvalitātes pilna genoma datiem, kas iegūti, izmantojot Macro & Micro-Test tehnoloģiju, pētniecības komanda ziņoja par vairākiem svarīgiem zinātniskiem atklājumiem:
Monoklonāla uzliesmojuma apstiprināšana:Visiem pieciem vīrusu izolātiem bija identisks pilna genoma genotips (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), ar tikai 0–1 atšķirībām viena nukleotīda polimorfismā (SNP), kas pārliecinoši pierāda, ka uzliesmojums radies no vienas pārneses ķēdes.
M2 genotipa atklāšana:Filoģenētiskā analīze atklāja, ka Lužou RVC celmi piederēja M2 genotipam, nevis M3 genotipam, kas iepriekš tika uzskatīts par dominējošu starp Ķīnas RVC celmiem. Šis atklājums apstrīd tradicionālo izpratni par RVC genotipa izplatību Ķīnā un apstiprina M2 genotipa parādīšanos Ķīnas dienvidrietumos.
Pierādījumi par starptautiskām pārneses saitēm:Pilna genoma salīdzinājums uzrādīja augstu ģenētisko līdzību starp Lužou celmiem un RVC celmiem, par kuriem iepriekš ziņots Juņnaņā (2025), Novosibirskā, Krievijā (2017) un Itālijā (2012), kas liecina par aktīva Eirāzijas pārneses tīkla esamību.
Ietekme uz profilaksi un kontroli: agrīna atklāšana un ātra iejaukšanās ir būtiska
Pēc patogēna identificēšanas Ludžou Slimību kontroles un profilakses centrs (CDC) nekavējoties ieviesa visaptverošus kontroles pasākumus, tostarp gadījumu izolēšanu, vides dezinfekciju, standartizētu vemšanas pārvaldību un pagaidu klases apturēšanu. Uzliesmojums tika veiksmīgi ierobežots viena inkubācijas perioda laikā, un pēc 21. oktobra netika ziņots par papildu gadījumiem.
Izmeklēšana sniedz arī svarīgu sabiedrības veselības mācību: klasterveida gastroenterīta uzliesmojumu gadījumā, kuros gan A grupas rotavīrusa, gan norovīrusa testi ir negatīvi, ikdienas diagnostiskajās pārbaudēs jāiekļauj C grupas rotavīruss un citi ne-A grupas rotavīrusi.
Šis pētījums atspoguļo pirmo ziņoto C grupas rotavīrusa uzliesmojumu Ķīnas dienvidrietumos un pirmo M2 genotipa identifikāciju reģionā, paplašinot pašreizējo izpratni par RVC epidemioloģiju Austrumāzijā. Šajā pētījumā Macro & Micro-Test integrētais risinājums, kas apvieno multipleksu PCR skrīningu ar pilna genoma bagātināšanas sekvencēšanu, parādīja ievērojamu praktisko vērtību, nodrošinot gan ātru patogēnu identifikāciju, gan augstas izšķirtspējas molekulārā avota izsekošanu, nodrošinot reproducējamu tehnisko ietvaru precīzai turpmāku infekcijas slimību uzliesmojumu izmeklēšanai un kontrolei.
Publicēšanas laiks: 2026. gada 30. jūlijs