Daudzvalstu reakcija uz Andu hantavīrusu klasteri: NAAT un pilna genoma sekvencēšana kā kritiski svarīgi rīki

2026. gada aprīlī zem Nīderlandes karoga kuģojošais polārās ekspedīcijas kruīza kuģisMS Hondiusizlidoja no Ušuajas, Argentīnā. 6. aprīlī pasažierim sākās drudzis un galvassāpes, un viņš piecas dienas vēlāk nomira uz klāja. Arī viņa sieva saslima un nomira pēc pārvešanas uz Dienvidāfriku. Pēc tam 69 gadus vecam britu pasažierim tika konstatēts pozitīvs hantavīruss, un viņš joprojām atrodas intensīvās terapijas nodaļā. Pasaules Veselības organizācija ziņoja, ka 13. maijā11 saslimšanas gadījumi un 3 nāves gadījumisaistīts ar uzliesmojumu uz kuģa.

I. Vīrusu pārskats un patogēnie tipi

Hantavīrusi ir RNS vīrusu grupa, ko galvenokārt pārnēsā grauzēji un kas pieder pie Orthohantavirus ģints Bunyaviridae dzimtā. To genoms sastāv notrīs segmenti (L, M un S), kas attiecīgi kodē no RNS atkarīgu RNS polimerāzi, glikoproteīnus un nukleokapsīda proteīnu. Pamatojoties uz ģeogrāfisko izplatību un klīniskajām izpausmēm, hantavīrusi tiek klasificēti kādivas galvenās grupas:

Vecās pasaules hantavīrusi(sastodamas Eiropā, Āzijā un Āfrikā) cēlonisHemorāģiskais drudzis ar nieru sindromu (HFRS)Pie tipiskiem vīrusiem pieder Hantaanas vīruss (HTNV), Seulas vīruss (SEOV) un Puumalas vīruss (PUUV). Tie galvenokārt iedarbojas uz nierēm, izraisot nieru darbības traucējumus, hemorāģiskas izpausmes un smagos gadījumos šoku. Mirstības rādītāji atšķiras atkarībā no vīrusa veida, bet parasti svārstās no<1% līdz 5–15%.

Jaunās pasaules hantavīrusi(cirkulē Ziemeļamerikā un Dienvidamerikā) izraisaHantavīrusa plaušu sindroms (HPS)Pie reprezentatīvajiem vīrusiem pieder Sin Nombre vīruss (SNV) un Andes vīruss (ANDV). Tie galvenokārt iedarbojas uz plaušām, izraisot strauji sākušos nekardiogēnu plaušu tūsku, smagu elpošanas distresu un sirds un asinsvadu sistēmas traucējumus. Sākotnējie simptomi ir gripai līdzīgi (drudzis, mialģija, kuņģa-zarnu trakta sūdzības), taču slimība var ātri progresēt līdz elpošanas mazspējai armirstības rādītāji sasniedz 30–50 %.

Kruīza kuģu uzliesmojumu galvenokārt izraisījaAndu vīruss (ANDV), kas pieder pieHantavīrusa plaušu sindroms (HPS)apakštips.

II. Tradicionālie ar HFRS saistītie hantavīrusi salīdzinājumā ar Andu vīrusu (HPS)

Tradicionālā HFRS

III. Pārraides veidi

Hantavīruss galvenokārt tiek pārnests caurtieša saskare ar inficētu grauzēju fekālijām, siekalām vai urīnuvai araerosola izdalījumu ieelpošanaCiti iespējamie maršruti ir šādi:

-Inficētu grauzēju sakodiens vai skrāpējums;

-Ēdot pārtiku, kas piesārņota ar inficētu grauzēju urīnu, izkārnījumiem vai siekalām;

- Pēc saskares ar piesārņotiem priekšmetiem pieskarties acīm, degunam vai mutei.

Pārnešana no cilvēka uz cilvēku ir ārkārtīgi reta, bet ir apstiprināts parAndu vīruss (ANDV).

IV. Globālā hantavīrusa kontaktu izsekošana — nukleīnskābju testēšana un sekvencēšana kā pamattehnoloģijas

Pēc ANDV uzliesmojuma veselības aizsardzības iestādes vairāk nekā desmit valstīs, tostarp Spānijā, Apvienotajā Karalistē, Amerikas Savienotajās Valstīs, Kanādā un Šveicē, vienlaikus uzsāka kontaktu izsekošanu un karantīnas uzraudzību. Francija, Amerikas Savienotās Valstis un citas valstis turpina izsekot to savu pilsoņu veselības stāvokli, kuri atgriezās no skartā kuģa.

Šajā daudzvalstu ārkārtas reaģēšanas procesānukleīnskābju testēšana un genoma sekvencēšanair spēlējuši neaizstājamu galveno lomu:

-Nukleīnskābju testēšanasniedz pārliecinošus pierādījumus ātrai patogēnu identificēšanai;

-Genomiskā sekvencēšanapiedāvā neaizstājamus molekulārus pierādījumus infekcijas avota izsekošanai, pārnešanas ķēžu apstiprināšanai un vīrusu izmaiņu novērtēšanai.

V. Hantavīrusa (īpaši HPS tipa) noteikšanas risinājumi

1. Agrīna patogēnu identificēšana

1.1 Aprūpes vietas testēšana (POCT)
Precīza skrīninga un neatliekamās palīdzības testi –no parauga līdz rezultātam 1 stundas laikā.
Diagnostikas izaicinājumi un ātri molekulāri risinājumi Aprūpes vietas testēšana
1.2 Parastā PCR
Parastā PCR

2. Sekvencēšanas risinājumi

Patogēnu identificēšanai un uzliesmojuma izsekošanai gadījumos, kadnezināmas izcelsmes drudzis, elpošanas distress vai hemorāģiskas izpausmes.
hemorāģiskas izpausmes

Galvenās funkcijas:

Galvenās funkcijas

VI. Pārbaudīti veiktspējas dati

Panākta hantavīrusu pozitīvu paraugu pilna genoma sekvencēšana, kuras pamatā ir zondes uztveršana>99% genoma pārklājums 30× dziļumā.
Pārbaudīti veiktspējas dati

Ir iespējama uz notekūdeņiem balstīta hantavīrusu genotipa noteikšana un apakštipu proporciju analīze.
apakštipa proporcija

VII. Saistītie komplekti

Saistītie komplekti


Publicēšanas laiks: 2026. gada 14. maijs