—— Džedzjanas CDC, Macro & Micro-Test un Ķīnas CDC kopīgs pētījums, publicēts žurnālā Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
Pētījuma pārskats
2026. gada maijā žurnālā “Frontiers in Cellular and Infection Microbiology” (JCR Q1, IF ≈ 4.6) tika publicēts raksts, ko vadīja Džedzjanas provinces Slimību kontroles un profilakses centrs (Džedzjanas CDC), un kura līdzautori bija bioinformātikas komanda no uzņēmuma “Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd.” un Nacionālā infekcijas slimību kontroles un profilakses institūta (Ķīnas CDC). Pētījuma nosaukums:
"Septiņu Brucella abortus celmu identifikācija un filoģenētiskā analīze Džedzjanā, Ķīnā."
Šis pētījums ir pirmā sistemātiskā, uz visa genoma balstītā Brucella abortus (B. abortus) filogenētiskās izsekojamības analīze Džedzjanas provincē, Ķīnā. Komanda analizēja septiņus izolātus, kas savākti no 2015. līdz 2025. gadam (četrus cilvēka izcelsmes un trīs liellopu izcelsmes celmus no Dzjiņhua, Kvudžou un Ningbo). Atklājumi sniedz genomiskus pierādījumus par šīs "ziemeļu dominējošās sugas" izcelsmi un pārnešanas ceļiem netipiskā dienvidu epidēmijas reģionā Ķīnas austrumos.
Konteksts un nozīme
Bruceloze ir zoonotiska slimība, ko izraisa Brucella ģints baktērijas. Brucella abortus galvenokārt inficē liellopus, bet var izraisīt slimības arī cilvēkiem. Ķīnā brucelozei ir raksturīgas ievērojamas ģeogrāfiskas atšķirības: visaugstākā saslimstība ir novērojama ziemeļu provincēs (piemēram, Iekšējā Mongolijā, Šaņsji, Heilundzjanā). Turpretī dienvidu provincēs, tostarp Džedzjanā, vēsturiski dominējusi Brucella melitensis, un ir ziņots par ļoti maziem B. abortus gadījumiem. Šī reģionālā atšķirība padara B. abortus ģenētisko raksturojumu un izcelsmes izsekošanu Džedzjanā par galveno sabiedrības veselības prioritāti.
Metodes un galvenie secinājumi
Pētnieku komanda pieņēma daudzpusīgu stratēģiju, apvienojot molekulāro bioloģiju un bioinformātiku:
1.Patogēnu identifikācija un pamata tipizēšana
BCSP-31 gēna PCR un AMOS-PCR apstiprināja, ka visi septiņi izolāti bija B. abortus.
Daudzlokusu secības tipizēšana (MLST), kuras pamatā ir deviņi saimniekgēni, atklāja, ka visi izolāti piederēja ST2 secības tipam, kas norāda uz augstu ģenētisko homogenitāti starp cirkulējošajiem B. abortus celmiem Džedzjanā.
2.Pilna genoma raksturojums
Pilna genoma sekvencēšana tika veikta, izmantojot Illumina NovaSeq platformu. Vidējās nukleotīdu identitātes (ANI) analīze parādīja, ka Džedzjanas izolātiem bija līdz pat 99,99% līdzība ar atsauces celmu B. abortus 544.
Pangenoma analīze atklāja ļoti konservētu populāciju: tika identificēti 3084 kodola gēni, kā arī tikai 10 čaulas gēni, un netika atklāti mīkstā kodola vai mākoņa gēni.
3.Virulences un pretmikrobu rezistences gēnu profili
Kopumā tika prognozēti 68 ar virulenci saistīti faktori, kas aptver klasiskos ceļus, piemēram, LPS biosintēzi, T4SS sekrēcijas sistēmu un BvrR-BvrS divkomponentu regulējošo sistēmu. Jāatzīmē, ka visiem izolātiem trūka adhezīna gēnu bmaA un btaF. Rezistences gēnu analīze CARD datubāzē atklāja tikai mprF gēnu, un citi rezistences determinanti netika identificēti.
4. Filoģenētiskā rekonstrukcija un transmisijas izsekošana
Kodola genoma viennukleotīdu polimorfisma (cgSNP) analīze novietoja Džedzjana izolātus noteiktā pozīcijā globālajā filoģenētiskajā kokā. Rezultāti parādīja, ka Džedzjana celmi veido monofilētisku grupu kopā ar celmiem no Krievijas, Mongolijas un vairākām ziemeļu Ķīnas provincēm (Ninsjas, Heilundzjanas, Iekšējās Mongolijas, Hebei, Gaņsu, Pekinas). Šī grupa tālāk sadalās trīs atšķirīgās apakškladēs (1.–3. klade), kas liecina par vairākiem neatkarīgiem ieviešanas notikumiem.
Secinājumi un ietekme
Šis pētījums sniedz pirmo augstas precizitātes B. abortus genomikas datu kopu Džedzjanas provincē un sniedz vairākus galvenos secinājumus:
- Klear ģenētiskais fons– Džedzjanā cirkulējošie B. abortus celmi pieder pie ST2, ir genomiski ļoti konservatīvi un pārstāv tipisku liellopu brucelozes līniju.
2. Evistarpreģionālās pārneses biežums– Filoģenētiskā analīze neatbalsta neatkarīgas endēmiskas līnijas esamību Džedzjanā. Tā vietā dati stingri liecina, ka šie celmi cēlušies no Ķīnas ziemeļiem un tiem varētu būt kopīga evolūcijas izcelsme ar celmiem no Krievijas un Mongolijas. Trīs apakškladu klātbūtne norāda uz vairākiem atsevišķiem ieviešanas notikumiem.
3. Ietekme uz sabiedrības veselību– Šie atklājumi uzsver brucelozes genomiskās uzraudzības vērtību pat tradicionāli neendēmiskajos reģionos, piemēram, Džedzjanā. Lai gan pašreizējais gadījumu skaits ir zems, augstas izšķirtspējas rīki, piemēram, cgSNP, var efektīvi izsekot ievesto uzliesmojumu avotu un sniegt zinātniskus pierādījumus, lai pārtrauktu ar starpprovinču mājlopu pārvadāšanu saistītās pārneses ķēdes.
Šis darbs ne tikai aizpilda pētījumu plaisu Džedzjanas provincē, bet arī sniedz jaunus sākotnējos datus patogēnu uzraudzībai un brucelozes riska novērtēšanai Jandzi upes deltas reģionā.
Informācija par dokumentu:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Septiņu Brucella abortus celmu identificēšana un filoģenētiskā analīze Džedzjanā, Ķīnā. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.
Publicēšanas laiks: 2026. gada 10. jūnijs