HIV-1 globālā un reģionālā molekulārā epidemioloģija laika posmā no 1990. līdz 2024. gadam: sistemātisks pārskats, globāls pētījums un izplatības analīze

Ievads

Nesen publicēts pētījumsLancet infekcijas slimības(2026) sniedz līdz šim visaptverošāko globālo HIV-1 molekulārās epidemioloģijas analīzi, integrējot sistemātisku pārskata datus un pasaules mēroga molekulārās uzraudzības apsekojumu.

Apvienojot iepriekš pieejamos datu kopumus (1990.–2021. g.) ar jaunizveidotiem secību datiem, pētījumā tika iekļauts vairāk nekā1,39 miljoni HIV-1 genotipa noteikšanas ierakstu no 154 valstīm, kas savākti laikā no 1990. līdz 2024. gadamIzmantojot UNAIDS aprēķināto ar HIV dzīvojošo cilvēku skaitu kā svēršanas faktorus, pētnieki izveidoja globālas un reģionālas kartes, kurās aprakstīts HIV-1 apakštipu, cirkulējošo rekombinanto formu (CRF) un unikālo rekombinanto formu (URF) laika un ģeogrāfiskais izplatījums.

Atzinumi liecina, ka, lai gan globālā HIV-1 apakštipa ainava pēdējo divu desmitgažu laikā ir saglabājusies relatīvi stabila, notiek ievērojamas reģionālās pārmaiņas, ko īpaši veicina rekombinanto formu daudzveidības pieaugums un paplašināšanās.

Studiju pamatinformācija

Cilvēka imūndeficīta vīruss 1. tipa (HIV-1) uzrāda plašu ģenētisko daudzveidību, pateicoties tā augstajam mutāciju ātrumam, rekombinācijas spējai un ilgtermiņa pārnešanas dinamikai.

Šai ģenētiskajai mainībai ir svarīga ietekme uz:

• · molekulārā uzraudzība,
• · diagnostiskās veiktspējas novērtējums,
• · pretretrovīrusu rezistences monitorings,
• · un vakcīnu izstrādes stratēģijas.

Pētījuma mērķis bija raksturot HIV-1 apakštipu un rekombinanto formu globālos un reģionālos izplatības modeļus no1990.–2024. g., nodrošinot atjauninātu molekulāro epidemioloģisko sistēmu globālai HIV profilaksei un kontrolei.

Studiju dizains un metodes

Pētnieki veica sistemātisku PubMed, Embase, Global Health un CINAHL datubāzu pārskatu, aptverot pētījumus, kas publicēti laikā no 2022. gada 1. janvāra līdz 2025. gada 22. janvārim.

Turklāt dati tika apkopoti, izmantojot Globālo HIV molekulārās epidemioloģijas sadarbības tīklu.

Iekļautie atbilstīgie datu kopumi:

• · Informācija par HIV-1 molekulāro apakštipu,
• · skaidri noteiktas paraugu ņemšanas vietas,
• · savākšanas datumi,
• · un pietiekams paraugu skaits.

Galīgajā datu kopā bija iekļauts:

• · 1 395 222 HIV-1 genotipa noteikšanas ieraksti 
• · 154 valstis 
• · seši epidemioloģiskie periodi:1990.–1999. gads, 2000.–2004. gads, 2005.–2009. gads, 2010.–2014. gads, 2015.–2019. gads, 2020.–2024. gads.

HIV-1 ģenētisko formu globālā un reģionālā izplatība tika novērtēta, izmantojot UNAIDS koriģētas svēršanas metodes.

HIV-1 apakštipu globālais izplatījums: C apakštips joprojām dominē

Laikā2020.–2024. g.C apakštips joprojām bija dominējošā HIV-1 līnija visā pasaulē, kas izskaidro:

Kopumā rekombinantās formas (tostarp CRF un URF) veidoja aptuveni22,4% no visiem HIV-1 inficēšanās gadījumiem pasaulē, uzsverot HIV-1 ģenētiskās daudzveidības pieaugošo sarežģītību.

C apakštips turpina dominēt galvenokārt:

• · Dienvidāfrika,
• · Dienvidāzija,
• · un vairākās Austrumāfrikas valstīs.

Tā kā šajos reģionos ir liela daļa no globālā HIV sloga, C apakštipa dominance spēcīgi ietekmē izplatības modeli visā pasaulē.

Reģionālās atšķirības: atšķirīgi evolūcijas modeļi dažādos kontinentos

Lai gan globālā HIV-1 struktūra šķiet relatīvi stabila, reģionālie modeļi piedzīvo būtiskas pārmaiņas.

Dienvidāfrika un Dienvidāzija: pastāvīga C apakštipa dominance

Dienvidāfrikai un Dienvidāzijai joprojām raksturīga C apakštipa cirkulācija.

Šajos reģionos ar augstu vīrusa slodzi C apakštips pārstāv lielāko daļu cirkulējošo vīrusu, padarot to par galveno C apakštipa globālās izplatības veicinātāju.

Tomēr pētījumā arī uzsvērts, ka molekulāro paraugu ņemšanas aptvērums dažos reģionos ar augstu vīrusa slogu joprojām ir ierobežots, kas liecina par papildu uzraudzības centieniem, lai labāk uztvertu vietējo vīrusu daudzveidību.

Ziemeļamerika un Latīņamerika: B apakštipa dominance turpinās

B apakštips joprojām ir galvenā cirkulējošā līnija:

• · Ziemeļamerika,
• · Latīņamerika.

Šiem reģioniem ir relatīvi stabili molekulārie epidemioloģiskie modeļi, salīdzinot ar reģioniem, kuros notiek straujākas apakštipu pārejas.

Rietumeiropa un Centrāleiropa: ģenētiskās daudzveidības pieaugums

Rietumeiropa un Centrāleiropa piedzīvo pakāpenisku pāreju no galvenokārt B apakštipa epidēmijas uz daudzveidīgāku vīrusu ainavu.

Galvenās tendences ietver:

• · B apakštipa īpatsvara samazināšanās,
• · rekombinanto formu ieguldījuma pieaugums,
• · pieaugoša ne-B līniju klātbūtne.

Šīs izmaiņas liecina, ka HIV-1 molekulārā daudzveidība kļūst arvien nozīmīgāka pat vēsturiski B apakštipa dominējošajos reģionos.

Austrumāzija: rekombinanto formu strauja izplatība

Austrumāzijā bija vērojama viena no nozīmīgākajām epidemioloģiskajām pārmaiņām.

Pētījumā tika atklāts, ka:

• · CRF07_BC līmenis laika gaitā ievērojami palielinājās,
• · B apakštipa izplatība ievērojami samazinājās.

CRF07_BC palielinājās no aptuvenino 13,1 % laikposmā no 2000. gada līdz 2004. gadam līdz 48,1 % laikposmā no 2020. gada līdz 2024. gadam, kas demonstrē būtiskas izmaiņas reģionālajā HIV-1 molekulārajā epidemioloģijā.

Šī transformācija uzsver nepārtrauktas molekulārās uzraudzības nozīmi reģionos, kur dominējošās kļūst rekombinantās formas.

Rekombinantās formas: pieaugoša globālās HIV-1 daudzveidības sastāvdaļa

Rekombinanto formu īpatsvars iepriekšējās desmitgadēs visā pasaulē ir palielinājies:

• · 2000.–2004. g.: aptuveni 20,8 %
• · 2010.–2014. g.: aptuveni 24,2 %
• · 2020.–2024. g.: aptuveni 22,4 %

Lai gan globālā proporcija pēdējā laikā nedaudz samazinājās, rekombinantās formas turpina izplatīties vairākos reģionos, jo īpaši:

• · Austrumāzija,
• · Rietumeiropa un Centrāleiropa.

Pētījums liecina, ka rekombinantās formas dažos apstākļos joprojām var tikt novērtētas par zemu, jo daudzas uzraudzības programmas galvenokārt balstās uz daļējiem genoma reģioniem, kas, iespējams, pilnībā neidentificē sarežģītus rekombinācijas modeļus.

Tāpēc būs svarīgi stiprināt genoma uzraudzības pieejas, jo īpaši reģionos ar augstu HIV transmisijas slogu un pieaugošu vīrusu daudzveidību.

Sabiedrības veselība un klīniskā ietekme

1. Diagnostikas sistēmām nepieciešama nepārtraukta starpapakštipu novērtēšana

Pieaugošā HIV-1 ģenētiskā daudzveidība uzsver diagnostikas tehnoloģiju pastāvīgas izvērtēšanas nozīmi dažādās vīrusu vidēs.

Lai gan pašreizējās HIV diagnostikas un vīrusu slodzes testēšanas platformas ir pierādījušas plašu piemērojamību, nepārtraukta validācija pret jauniem apakštipiem un rekombinantām formām joprojām ir būtiska.

Turpmākajā uzraudzībā jāiekļauj:

• · molekulārā epidemioloģija,
• · diagnostikas veiktspējas uzraudzība,
• · un vīrusu evolūcijas analīze.

2. Zāļu rezistences uzraudzībai nepieciešams plašāks ģenētiskais tvērums

Dažādu HIV-1 līniju paplašināšanās var ietekmēt ar rezistenci saistītu mutāciju rašanos, atklāšanu un interpretāciju.

Dažos pētījumos ir norādīts, ka specifiskas HIV-1 līnijas, tostarp ar A6/A1 saistītie varianti, var būt saistītas ar paaugstinātu viroloģiskās neveiksmes risku noteiktos ilgstošas ​​darbības kabotegravira/rilpivirīna terapijas apstākļos.

Tomēr rezistences iznākumu ietekmē vairāki faktori, tostarp:

• · sākotnējās rezistences mutācijas,
• · ārstēšanas vēsture,
• · ievērošana,
• · un vīrusu ģenētiskais fons.

Tāpēc arvien svarīgāka kļūst apakštipu apzinīga rezistences uzraudzība.

3. Vakcīnu izstrādē jāņem vērā reģionālā vīrusu daudzveidība

HIV-1 plašā ģenētiskā daudzveidība joprojām ir viens no galvenajiem izaicinājumiem vakcīnu izstrādē.

Apakštipu un rekombinanto formu mainīgā izplatība uzsver nepieciešamību pēc vakcīnu stratēģijām, kas ņem vērā:

• · reģionāli cirkulējoši celmi,
• · vīrusu evolūcijas tendences,
• · un plašāku imūnsistēmas pārklājumu.

Globāli vienota pieeja, iespējams, pilnībā neatrisinās visā pasaulē cirkulējošā HIV-1 daudzveidību.

Secinājums

Šī nozīmīgā globālā HIV-1 molekulārās epidemioloģijas analīze parāda, ka pasaules vīrusu ainavu raksturo gan nepārtrauktība, gan pārmaiņas.

Lai gan C apakštips joprojām veido gandrīz pusi no globālajām HIV-1 infekcijām, reģionālie molekulārie modeļi strauji attīstās, un rekombinantās formas arvien vairāk ietekmē epidēmijas tādās vietās kā Austrumāzija un Eiropa.

Šie atklājumi pastiprina ilgstošas ​​molekulārās uzraudzības, starpdisciplināras diagnostikas validācijas un integrētu genomikas pieeju nozīmi, lai atbalstītu efektīvu HIV profilaksi, ārstēšanas uzraudzību un turpmāku vakcīnu izstrādi.

Atsauce

1. HIV-1 globālā un reģionālā molekulārā epidemioloģija 1990.–2024. gadā: sistemātisks pārskats, globāls pētījums un izplatības analīze. Lancet infekcijas slimības, 2026.