Nesen veikts metagenomikas pētījums atklāja ievērojami daudzveidīgu vīrusu un baktēriju spektru, ko Heilundzjanas provincē pārnēsā grauzēji, tostarp Lassa vīrusu, Amūras vīrusu, Salmonella un Yersinia pestis.
Pētījumā tika izmantotaPatogēnu RNS bagātināšanas komplekts no Macro & Micro-Test, pamatojoties uz zondes uztveršanas tehnoloģiju. Selektīvi noplicinot saimnieka rRNS un citus konservētus saimnieka fragmentus, metode efektīvi saglabāja mikrobu RNS, ievērojami uzlabojot patogēnu noteikšanas jutību. Šis patogēnu RNS bagātināšanas solis bija kritiski svarīgs, lai sasniegtu augstu noteikšanas līmeni, un nodrošināja spēcīgu tehnisko atbalstu patogēnu uzraudzībai.
Grauzēji: galvenie zoonotisko slimību rezervuāri
Grauzēji ir sugām bagātākā un visplašāk izplatītā zīdītāju grupa, kas aptver vairāk nekā 2000 sugu visā pasaulē un veido vairāk nekā 40% no visām zīdītāju sugām.
Papildus ekoloģiskajai nozīmei grauzēji kalpo kā daudzu zoonožu patogēnu galvenie rezervuāri un pārnēsātāji.Tā kā grauzēju dzīvotnes bieži pārklājas ar cilvēku vidi — tiešiem kodumiem, saskarē ar izkārnījumiem vai netiešu pārnešanu ar blusām un ērcēm —, patogēni, ko tie pārnēsā, rada pastāvīgus draudus sabiedrības veselībai.
Jāatzīmē, ka vairāk nekā 70 % jauno infekcijas slimību rodas savvaļas dzīvnieku vidū, un grauzēji ir viens no nozīmīgākajiem vīrusu rezervuāriem.
Heilundzjanas pierobežas reģions: patogēnu uzraudzības frontes līnija
Heilundzjana, pierobežas province Ķīnas ziemeļaustrumos, ir bagāta ar ekoloģiskajiem resursiem un robežojas ar vairākām valstīm. Bagātīgā bioloģiskā daudzveidība un bieža iedzīvotāju pārvietošanās pāri robežām rada labvēlīgus apstākļus patogēnu pārnešanai.
Laikā no 2021. gada jūnija līdz jūlijam pētnieki Hengdaohezi pilsētā, Mudanjiangas pilsētā, savāca 67 savvaļas grauzējus. Paraugos bija iekļauti:
l 20Apodemus pussala
47. lpp.Myodes rufocanus
Visi eksemplāri tika notverti dzīvojamajās zonās un apkārtējās lauksaimniecības zemēs, uzsverot ciešo saskarni starp cilvēku apmetnēm un savvaļas dzīvnieku dzīvotnēm.
Patogēnu bagātināšanas tehnoloģija: saimnieka fona traucējumu pārvarēšana
Metagenomiskajā sekvencēšanā saimnieka RNS parasti dominē sekvencēšanas lasījumos, maskējot zema patogēnu daudzuma signālus.
Lai risinātu šo problēmu, pētījumā tika izmantotsMacro & Micro-Test patogēnu metagenomikas noteikšanas komplekts. Izmantojot zondes uztveršanas tehnoloģiju, īpaši izstrādātas zondes saistās ar saimnieka rRNS un konservētajām sekvencēm, nodrošinot to noplicināšanu un tādējādi bagātinot mikrobu RNS.
Šī pieeja ievērojami uzlaboja patogēnu noteikšanas jutību, ļaujot lejupējā sekvencē atgūt lielāku patogēnu nolasījumu daļu. Bagātināšanas solis lika stabilu pamatu grauzēju pārnēsātā patogēnu spektra precīzai raksturošanai.
Pēc bagātināšanas RNS paraugiem tika veikta reversā transkripcija, bibliotēkas veidošana un augstas caurlaidības sekvencēšana. Bioinformātiskā analīze ietvēra:
Saimnieka genoma filtrēšana
Taksonomiskā klasifikācija, izmantojot Kraken2
l Pārpilnības korekcija ar papardēm
Šī darbplūsma ģenerēja visaptverošu vīrusu un baktēriju kopienu profilu.
Pētījuma rezultāti: vairāku vīrusu un baktēriju vienlaicīga cirkulācija
Vīrusu atradumi
Atklātie vīrusi piederēja 21 vīrusu dzimtai, tostarpArenaviridaeunHantavīrusu dzimta.
Caurno jaunaVeicot Megahit montāžu, tika ģenerēti 154 vīrusu kontigi, no kuriem 110 sakrita ar 19 vīrusiem no astoņām dzimtām.
In Apodemus pussalatika identificēti šādi vīrusi:
l Arenavīrusi: Lassa vīruss, Venžou vīruss, Gairo vīruss
l Hantavīrusi: Amūras vīruss, Puumalas vīruss
In Myodes rufocanusTika atklāts žurku arterivīruss un Amūras vīruss.
Starp šiem patogēniem:
Lassa vīruss ir vīrusu hemorāģiskā drudža izraisītājs, un mirstības līmenis sasniedz aptuveni 20 %.
Amūras vīruss ir viens no patogēniem, kas izraisa hemorāģisko drudzi ar nieru sindromu (HFRS). Ķīna ziņo par vislielāko hantavīrusu infekciju slogu pasaulē.
Baktēriju atradumi
Kopumā tika anotētas 1051 baktēriju ģints.
Visizplatītākās ģintis bija:
lSalmonella(26–31 %)
lJersīnija(11–23 %)
Salmonellair galvenais ar pārtiku izplatīts patogēns, kas katru gadu visā pasaulē izraisa aptuveni 9 miljonus vēdertīfa gadījumu un aptuveni 110 000 nāves gadījumu.
Yersinia pestis, mēra izraisītājs, ir izraisījis trīs vēsturiskas pandēmijas. Heilundzjanas province ir atzīta par vienu no Ķīnas dabiskajiem mēra perēkļiem un joprojām ir prioritārs reģions mēra uzraudzībai.
Pētījuma nozīme
Zinātniskie ieguldījumi
Šis pētījums ir pirmais ziņojums par Lassa vīrusa fragmentiem un žurku arterīta vīrusu grauzējiem no Heilundzjanas, paplašinot Ķīnas grauzēju pārnēsāto patogēnu datubāzi.
Tas sistemātiski raksturo vīrusu un baktēriju kopienas vietējās grauzēju populācijās, sniedzot sākotnējos datus zoonožu uzraudzībai pierobežas reģionos.
Ietekme uz sabiedrības veselību
Secinājumi uzsver nepieciešamību pēc nepārtrauktas uzraudzības un patogēnu skrīninga.A. pussalaunM. rufocanus.
Dati sniedz zinātniskus pierādījumus, kas atbalsta avotu kontroles stratēģijas tādām slimībām kā mēris un hemorāģiskais drudzis ar nieru sindromu.
Metodoloģiskās stiprās puses
Metagenomiskā sekvencēšana ļauj objektīvi noteikt gan zināmus, gan jaunus patogēnus.
Šajā pētījumā Macro & Micro-Test patogēnu bagātināšanas tehnoloģija uzrādīja labu veiktspēju, efektīvi uzlabojot mērķa patogēnu noteikšanu sarežģītos bioloģiskos paraugos. Rezultāti apstiprina tās spēju atbalstīt augstas jutības patogēnu identificēšanu savvaļas dzīvnieku uzraudzībā.
Produkta ieteikums
Pamatojoties uz veiksmīgo pielietojumu šajā pētījumā, Macro & Micro-Test Patogen RNS bagātināšanas komplekts ir ļoti ieteicams metagenomikas uzraudzības pētījumiem.
Efektīvi samazinot saimnieka nukleīnskābes un bagātinot mikrobu sekvences, komplekts ievērojami uzlabo noteikšanas jutību un datu kvalitāti. Tas ir būtisks instruments precīzai patogēnu atklāšanai sarežģītos paraugos un nodrošina stabilu tehnisko atbalstu sabiedrības veselības uzraudzībai, zoonožu riska novērtēšanai un gatavībai uzliesmojumiem.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Publicēšanas laiks: 2026. gada 2. marts