Jauns ierocis tuberkulozes diagnozei un zāļu rezistences noteikšanai: jaunas paaudzes mērķtiecīga secība (TNG) apvienojumā ar mašīnmācīšanos tuberkulozes paaugstinātas jutības diagnozei
Literatūras ziņojums: CCA: diagnostikas modelis, kura pamatā ir TNGS un mašīnmācība, kas ir piemērots cilvēkiem ar mazāk baktēriju tuberkulozi un tuberkulozo meningītu.
Darba nosaukums: Tuberculous mērķtiecīga nākamās paaudzes sekvencēšana un mašīnu apgūšana: īpaši jutīga diagnostikas stratēģija paucificētu plaušu cauruļveida un cauruļveida meningītu.
Periodisks: 《Clinica Chimica Acta》
Ja ： 6.5
Publicēšanas datums: 2024. gada janvāris
Apvienojumā ar Ķīnas Universitātes Zinātņu akadēmiju un Pekinas Krūškurvja slimnīcas kapitāla medicīnas universitāti, makro un mikro testu izveidoja tuberkulozes diagnozes modeli, kura pamatā ir jaunās paaudzes mērķa secības (TNGS) tehnoloģija un mašīnu apguves metode, kas nodrošināja īpaši augstu Tuberkulozes noteikšanas jutība ar dažām baktērijām un tuberkulozu meningītu nodrošināja jaunu paaugstinātas jutības diagnozes metodi divu veidu klīniskajai diagnozei tuberkulozes un palīdzēja precīzai diagnozei, zāļu rezistencei noteikšanai un tuberkulozes ārstēšanai. Tajā pašā laikā tiek atklāts, ka pacienta cfDNS plazmā var izmantot kā piemērotu parauga veidu klīniskai paraugu ņemšanai TBM diagnozē.
Šajā pētījumā tika izmantoti 227 plazmas paraugi un cerebrospinālā šķidruma paraugi, lai izveidotu divas klīniskās kohortas, kurās laboratorijas diagnostikas kohortas paraugi tika izmantoti, lai izveidotu tuberkulozes diagnozes mašīnu apguves modeli, un klīniskās diagnostikas kohortas paraugi tika izmantoti, lai pārbaudītu noteiktu, ka noteikta klīniskā diagnostiskā kohortas paraugi, lai pārbaudītu noteiktu paraugus Diagnostikas modelis. Visus paraugus vispirms mērķēja ar speciāli izveidotu mērķtiecīgu uztveršanas zondes baseinu Mycobacterium tuberculosis. Pēc tam, pamatojoties uz TB-TNGS sekvencēšanas datiem, lēmumu koku modeli izmanto, lai veiktu 5 reizes savstarpēju validāciju laboratorijas diagnostikas rindas apmācības un validācijas komplektos, kā arī tiek iegūti plazmas paraugu un cerebrospinālā šķidruma paraugu diagnostikas sliekšņi. Iegūtais slieksnis tiek ievadīts divos klīniskās diagnozes rindas testu komplektos noteikšanai, un izglītojamā diagnostisko veiktspēju novērtē ar ROC līkni. Visbeidzot, tika iegūts tuberkulozes diagnozes modelis.
1. attēls
Rezultāti: Saskaņā ar īpašajiem CSF DNS parauga (AUC = 0,974) un plazmas cfDNS parauga (AUC = 0,908) sliekšņiem šajā pētījumā, starp 227 paraugiem, CSF parauga jutība bija 97,01%, specifiskums bija 95,65%, un un Plazmas parauga jutība un specifiskums bija 82,61% un 86,36%. Analizējot 44 pāra cfDNS plazmas un cerebrospinālā šķidruma DNS paraugu no TBM pacientiem, šī pētījuma diagnostikas stratēģijai ir augsta konsistence 90,91% (40/44) cfDNS plazmā un cerebrospinālā šķidruma DNS, un jutība ir 95,45%% un cerebrospinālā šķidruma DNS, un jutība ir 95,45%%%%%%% un 95,45%. (42/44). Bērniem ar plaušu tuberkulozi šī pētījuma diagnostikas stratēģija ir jutīgāka pret plazmas paraugiem nekā to pašu pacientu kuņģa sulas paraugu Xpert noteikšanas rezultāti (28,57% pret 15,38%).
2. attēls
3. attēls pāra paraugu diagnostiskie rezultāti
Secinājums: Šajā pētījumā tika izveidota paaugstināta jutīga diagnostikas metode tuberkulozei, kas var nodrošināt diagnostikas rīku ar visaugstāko noteikšanas jutīgumu klīniskiem pacientiem ar oligobakilāru tuberkulozi (negatīva kultūra). Paaugstināta jutīga tuberkulozes noteikšana, pamatojoties uz plazmas cfDNS, var būt piemērots parauga tips aktīvās tuberkulozes un tuberkulozā meningīta diagnosticēšanai (plazmas paraugus ir vieglāk savākt nekā cerebrospināla šķidruma pacientiem, kuriem ir aizdomas par smadzeņu tuberkulozi).
Sākotnējā saite: https://www.scienceDirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? Via%3dihub
Īsa makro un mikro testa tuberkulozes sērijas noteikšanas produktu ieviešana
Ņemot vērā sarežģīto tuberkulozes pacientu un dažādu vajadzību paraugu situāciju, makro un mikro testi nodrošina pilnīgu NGS risinājumu kopumu sašķidrināšanas ekstrakcijai no krēpu paraugiem, Qualcomm bibliotēkas veidošanu un secību, kā arī datu analīzi. Produkti aptver ātru tuberkulozes pacientu diagnozi, tuberkulozes noteikšanu zāļu rezistencē, Mycobacterium tuberculosis un NTM tipizē, baktēriju negatīvas tuberkulozes un tuberkulozu cilvēku paaugstinātas jutības diagnozi utt.
Sērijas noteikšanas komplekti tuberkulozei un mikobaktērijām:
| Vienums Nr | produkta nosaukums | Produktu testēšanas saturs | parauga tips | piemērojams modelis |
| HWTS-3012 | Paraugu izdalīšanās aģents | Izmanto krēpu paraugu sašķidrināšanas apstrādē, ir ieguvis pirmās klases rekorda numuru, Sutong mašīnu aprīkojumu 20230047. | krēpas | |
| HWTS-NGS-P00021 | Qualcomm daudzuma noteikšanas komplekts paaugstinātas jutīgai tuberkulozei (zondes uztveršanas metode) | Neinvazīva (šķidrā biopsija) paaugstināta jutības noteikšana baktēriju negatīvām plaušu tuberkulozes un smadzeņu mezgliņiem; Cilvēku paraugi, par kuriem ir aizdomas, ka tie ir inficēti ar tuberkulozi, vai ne-tuberkulozes mikobaktērijas, tika analizēti ar augstas padziļinātas sekvencējošu metagenomiku, un tika inficēta informācija par to, vai tuberkuloze vai ne-tuberkulozes mikobaktērija, un galvenā pirmās līnijas zāļu rezistences informācija par mikobaktēriju Tuberculosisculosis, kas ir pirmās līnijas zāļu rezistences informācija, kas nav saistīta ar mycobacterium tuberculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculosisculozi, nav paredzēta pirmās līnijas zāļu rezistences informāciju par zāļu rezistenci, kas saistīta ar zāļu rezistenci. tika nodrošināti. | Perifērās asinis, alveolārā skalošanas šķidrums, hidrotorakss un ascīts, fokusa punkcijas paraugs, cerebrospinālais šķidrums. | Otrās paaudzes |
| HWTS-NGS-T001 | Mycobacterium mašīnrakstīšana un zāļu izturības noteikšanas komplekts (multipleksa pastiprināšanas sekvencēšanas metode) | Mycobacterium tipizēšanas tests, ieskaitot MTBC un 187 NTM；Mycobacterium tuberkulozes noteikšana zāļu rezistencē aptver 13 zāles un 16 zāļu rezistences gēnu kodolu mutācijas vietas. | Krēpas, alveolārā skalošanas šķidrums, hidrotorakss un ascīts, fokusa punkcijas paraugs, cerebrospinālais šķidrums. | Otrās/trešās paaudzes dubultā platforma |
Svarīgākie notikumi: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium mašīnrakstīšana un zāļu izturības noteikšanas komplekts (multipleksa pastiprināšanas metode)
Produkta ievads
Produkta pamatā ir galvenās pirmās un otrās rindas zāles, kas aprakstītas PVO TB ārstēšanas vadlīnijās, makrolīdos un aminoglikozīdos, ko parasti izmanto NTM ārstēšanas vadlīnijās, un zāļu rezistences vietas aptver visu vienu ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistīta ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu zāļu grupā, kas saistītas ar narkotikām, kas saistītas ar narkotikām saistītu vietu grupu, narkotikām. Kurš Mycobacterium tuberculosis kompleksa mutāciju katalogs, kā arī citi paziņotie zāļu rezistences gēni un mutācijas vietas saskaņā ar izmeklēšanu un statistiku par Literatūra ar augstu punktu skaitu mājās un ārzemēs.
Identifikācijas rakstīšanas pamatā ir NTM celmi, kas apkopoti NTM vadlīnijās, ko publicēja ķīniešu žurnāls par tuberkulozi un elpceļu slimībām, kā arī ekspertu vienprātību. Izstrādātie tipizēšanas grunti var pastiprināt, secīgi un anotēt vairāk nekā 190 NTM sugas.
Izmantojot mērķtiecīgu multipleksa PCR amplifikācijas tehnoloģiju, tika pastiprināti ar Mycobacterium gēniem un zāļu izturīgajiem gēniem, kas tika pastiprināti ar multipleksu PCR, un tika iegūta noteikto mērķa gēnu kombinācija. Pastiprinātus produktus var izveidot otrās paaudzes vai trešās paaudzes augstas caurlaides spējas sekvencēšanas bibliotēkās, un visas otrās paaudzes un trešās paaudzes sekvencēšanas platformas var pakļaut augstas padziļinātai secībai, lai iegūtu mērķa gēnu secības informāciju. Salīdzinot ar zināmajām mutācijām, kas atrodas iebūvētajā atsauces datu bāzē (ieskaitot PVO Mycobacterium tuberculosis kompleksa mutāciju katalogu un tā saistību ar zāļu rezistenci), tika noteiktas mutācijas, kas saistītas ar zāļu rezistenci vai anti-tuberkulozes zāļu jutīgumu. Apvienojumā ar makro un mikro testa pašvērtēto krēpu parauga apstrādes šķīdumu klīnisko krēpu paraugu zemas nukleīnskābes pastiprināšanas efektivitātes problēma (desmit reizes lielāka par tradicionālajām metodēm) tika atrisināta, lai zāļu rezistences secības noteikšana var būt tieši piemēroti klīniskajiem krēpu paraugiem.
Produktu noteikšanas diapazons
34ar zāļu rezistenci saistīti gēni18anti-tuberkulozes zāles un6Tika atklātas NTM zāles, aptverot297narkotiku rezistences vietas; Desmit veidu Mycobacterium tuberculosis un vairāk nekā190Tika atklāti NTM veidi.
1. tabula: Informācija par 18+6 narkotikām+190+NTM
Produkta priekšrocība
Spēcīga klīniskā pielāgošanās spējas: krēpu paraugus var tieši noteikt ar pašsavienojuma līdzekli bez kultūras.
Eksperimentālā darbība ir vienkārša: pirmā pastiprināšanas darbības kārta ir vienkārša, un bibliotēkas konstrukcija ir pabeigta 3 stundu laikā, kas uzlabo darba efektivitāti.
Visaptveroša mašīnrakstīšana un narkotiku rezistence: MTB un NTM tipizēšanas un zāļu rezistences vietas, kas ir galvenie klīnisko problēmu punkti, precīza tipizēšanas un zāļu rezistences noteikšana, neatkarīgas analīzes programmatūras atbalstīšana un analīzes pārskatu ģenerēšana ar vienu klikšķi.
Saderība: produktu savietojamība, pielāgošanās galvenajām ILM un MGI/ONT platformām.
Produkta specifikācija
| Produkta kods | produkta nosaukums | Atklāšanas platforma | specifikācija |
| HWTS-NGS-T001 | Mycobacterium mašīnrakstīšana un zāļu rezistences noteikšanas komplekts (multipleksa pastiprināšanas metode) | Ont 、 Illumina 、 MGI 、 Salus Pro | 16/96rxn |
Pasta laiks: 23.-2024. Janvāris